Flaggen gehören wie Nationalhymnen zu den Symbolen der Gemeinschaft. Nationalflaggen, die einen Staat darstellen, sind meist rechteckig und stellen offizielle Symbole des Staates dar.Fehlender Respekt und Aufmerksamkeit gegenüber Nationalflaggen fällt in vielen Staaten unangenehm auf und kann zu unliebsamen Reaktionen führen. In manchen Staaten kann es sogar unter Strafe stehen

Der Flaggengruß von Yachten untereinander durch Dippen der Nationalen* ist mittlerweile aus der Mode gekommen. Bei Begegnung mit Marineschiffen wird sie allerdings immer noch praktiziert. Dabei grüßt (dippt) das zivile Schiff zuerst. Bei Flottillen muss man sich nicht den Arm verrenken, sondern es wird ausschließlich das durch den Führungsstander gekennzeichnete Schiff gegrüßt.

Bei festlichen Anlässen flaggen alle Yachten im Hafen, vor Anker oder in Fahrt über die Toppen. Dafür dürfen jedoch nur Signalflaggen gesetzt werden ... und das auch noch in einer festgelegten Reihenfolge: je zwei rechteckigen Buchstabenflaggen folgt ein dreieckiger Zahlenwimpel.

Eine alternative Regel besagt, dass bei Festlichkeiten die richtige Reihenfolge der Beflaggung vom Vorschiff nach Achtern folgendermaßen lautet: A, B, C, 1, D, E, F, 2, G, H, I, 3, ..., 8, Y, Z, 9, 0 (Null) Da hilft nur, sich im Zweifelsfall am eingeborenen Nachbarn zu orientieren.

Soll dabei ein fremder Staat geehrt werden, weht dessen Nationale im Topp - die eigene Nationale bleibt jedoch in jedem Fall am Heck.

Jeder Deutsche darf auf seinem Schiff ausschließlich die Bundesflagge - auch bekannt als "Adenauer" - am Heck führen. Auf Seeschifffahrtsstraßen, in Küstengewässern, auf See und im Ausland muss er die Bundesflagge führen. Das gilt auch für den Nort-Ostsee-Kanal, auf der Elbe unterhalb des Hamburger Hafens, auf der Weser unterhalb Bremens und auf der Ems unterhalb Papenburgs.
Auch auf ausländischen Binnengewässern empfiehlt es sich, die Bundesflagge zu führen, obwohl es nicht überall Vorschrift ist.

Die Nationalflagge wird an einem mit 40° geneigten Flaggenstock mittschiffs am Heck angebracht. Sollte mittschiffs kein Platz sein, weicht man nach Steuerbord aus. Nur wenn auch dort kein Platz ist, kann nach Backbord ausgewichen werden. (Einige Hersteller sehen die Halterung für die Nationalflagge bereits werkseitig an Backbord vor. Wenn möglich, sollte dies angepasst werden.)

Andere Flaggen, wie Europaflaggen, Piratenflaggen und Verbandsflaggen haben am Heck nichts zu suchen.

Es ist allgemein üblich, bei Auslandstörns zusätzlich zur eigenen Nationalen auch die Nationale des Gastlandes zu zeigen. Diese sollte grundsätzlich höher am Mast wehen, als die eigene Nationale steht. Idealerweise wird sie an der Steuerbord-Saling gesetzt. Wenn diese Anbringung nicht möglich ist, gelten folgende Ausweichregeln:

1. Steuerbord am Geräteträger (wenn die eigene Nationale dort noch nicht steht)
2. Als Gösch (Flagge, die im eigenen Flaggenstock am Bug gefahren wird)
3. Über der eigenen Nationalen am Heck

Wenn eine Gastlandflagge an der Steuerbord-Saling gesetzt ist, weht sie dort allein. Nur drei Ausnahmen sind zulässig:

1. an dem Tag, wenn man von einer Reise durch mehrere Länder wieder in Heimatgewässer einläuft
2. am Tag des feierlichen Abfahrens
3. Beim Befahren eines Grenzflusses dürfen beide Nationalflaggen der Gastländer gesetzt werden

Sie darf nur von Wasserfahrzeugen, deren Eigner Mitglied in einem Verbandsverein des Deutschen Motoryachtverbandes sind, gefahren werden. Bei Yachten mit Mast wird die Flagge im Inland unter der Steuerbord-Saling gefahren. Im Ausland weicht sie der Gastlandflagge und geht auf die Backbordseite. Bei mastlosen Yachten wird sie in der Bootsmitte angebracht.

Das Schleusenpersonal erkennt an der Flagge die Mitgliedschaft im Deutschen Motoryachtverband, der pauschal für die Sportbootfahrer die Schleusengebühren im deutschen Binnenland bezahlt.

Der Vereins- bzw. Clubstander ist ein wichtiges Erkennungsmerkmal für die Herkunft von Boot und Eigner. Er weht am höchsten Punkt des Bootes; im Idealfall also am Masttopp. Wer Mitglied in mehreren Vereinen ist, setzt im Heimathafen den heimischen Stander und in fremden Häfen den des ältesten ortsansässigen Clubs in dem er Mitglied ist.

Diese Stander können ebenfalls als Gösch (im eigenen Flaggenstock am Bug) gefahren werden, weichen jedoch im Zweifelsfall der Gastlandflagge.

Stander von Persönlichkeiten werden auf Yachten mit Mast gesetzt, solange die Persönlichkeit an Bord ist.

Unabhängig von diesen Regeln sind die Vorschriften der Behörden über das Führen besonderer Flaggen und Stander zu beachten.

Als Zeichen der Trauer wird die Nationalflagge halbstock (halbmast) gesetzt. Sollte das nicht möglich sein, kann ein Trauerflor über der Nationalflagge gesetzt werden.

Normalerweise wird nur im Hafen oder vor Anker Trauer gezeigt. In Fahrt wird es üblicherweise nur gezeigt, wenn ein Toter an Bord ist.

Die Trauer endet mit dem Ende der Beerdigung des Toten.